フロイトとは原因論と目的論など臨床理論の原理が全く異なり、内容は整合せず、互いに混ぜ合わせることはできません。むしろ認知行動療法などが理論的には共通部分を持ちますが、治療戦略が異なるため、そのままでは臨床現場での動きは相容れません。
心理学理論は大変に多岐にわたり、そのすべてについては言及できないため、おおむね例に出された範囲内で述べさせていただきます。
フロイトやユングの理論とアドラー心理学との関係性については、特にフロイトとは、臨床理論面においてほぼ全面的に対立すると考えられます。元々アドラーはフロイトの精神分析運動の初期メンバーでしたが、方向性の相違から後に袂を分かつことになりました。原因論や性的欲動を重視するフロイトに対し、アドラーはそれらに真っ向から対立する、目的論、劣等感と補償、社会的関心（共同体感覚）を重視しました。またフロイトは無意識について、人の心の中の意識とは常に対立する領域であって、そこから生じるエネルギーによって人が動かされる、といったように実体的、機械論的に捉えていたのに対して、アドラーは無意識を概念としては認めるものの、あくまでそれは全体としての個人の意識されていない側面であり、したがって意識と対立するものではないと考えていました。このように、それぞれの臨床理論は原理の異なる異質な体系のため、内容は全く整合せず、互いに混ぜ合わせることはできません。それはユングの理論においても然りで、アドラー心理学では例えばペルソナへの解釈も独自のものとなります。
なお、臨床理論面においてアドラー心理学によく似たものとしては、アルバート・エリスの『論理情動療法 Rational Emotive Therapy』やアーロン・ベックの『認知行動療法 Cognitive Behavior Therapy』をあげることができます。それらは個人の主体性を認めており、目的論的で、全体論的でもあります。また、対人関係論や認知論としても共通するといえます。しかし治療における戦略がアドラー心理学と全く異なるため、そのままでは臨床の現場での動きは相容れません。
そのため、私どもAIJで提供する育児コース、ワークショップおよび講座においては（過去に野田俊作が開発した技法、野田俊作のもとでアドラーギルドが提供していたコース等も含む）、そのひとつひとつを基本的に構成している、またはそこでお伝えしている臨床理論と思想は純粋にアドラー心理学のみに基づいており、臨床的に有用な他派の知見を用いる際も、アドラー心理学の立場から再解釈した『技法』に限っての導入としています。たとえば育児コース『パセージ』や過去に開発し提供していたSMILEでは、心理療法で一般的に用いられている認知行動療法等の技法も併用していますが、その用い方は完全にアドラー心理学に基づいたものとなっています。